Erkrankungen der Atmungsorgane (ICD/10 J00 – J99) nehmen den größten Anteil an den AU-Fällen insgesamt ein. An Krankheitsbildern reicht das Spektrum von einer einfachen Erkältung über eine Grippe bis zur Lungenentzündung. Die Atmungsorgane werden in obere Atemwege mit typischen Erkrankungen wie Schnupfen, Heuschnupfen oder Halsentzündung und in untere Atemwege mit Erkrankungen wie Bronchitis oder Asthma unterteilt. Als Untergruppen der Atemwegserkrankungen werden Erkältungen (ICD/10 J00-J11; J20-J22; J40) und chronische Atemwegserkrankungen (ICD/10 J31-J32; J35; J41-J47) unterschieden. Während Erkältungskrankheiten stark von klimatischen Einflüssen (Arbeiten im Freien, schlecht klimatisierte Büros etc.) begünstigt werden, werden chronische Atemwegserkrankungen wie z. B. Asthma und chronische Bronchitis i.d.R. durch organische und anorganische Stäube, Chemikalien und Dämpfe beeinflusst. Auch Allergien und das Rauchen können zu Atemwegserkrankungen führen.