En septembre 2012, un nouveau coronavirus, appelé MERS-CoV, apparaît en Arabie Saoudite. Proche du SRAS, il a probablement été transmis à un homme par une chauve-souris. Fin mai 2013, on compte une quarantaine de victime, dont 18 cas mortels. La crainte majeure est alors qu'il se transmette d'homme à homme. Le MERS-nCoV progresse lentement et les principaux symptômes sont l'apparition brutale d'un syndrome grippal sévère, avec une fièvre de 40°C, diarrhées et insuffisance rénale.

En France, un cas déclaré, de retour d'Arabie saoudite, a présenté une atteinte pulmonaire grave qui a nécessité une CEC (circulation extracorporelle) pour oxygéner le sang et remplacer ainsi les poumons momentanément défaillants. Cette personne est décédée le 28 mai 2013 et représente donc le premier décès dû à ce virus en France.

Le deuxième cas est son voisin de chambre à l'hôpital, ce qui semble confirmer que la contamination soit possible par contact direct et, en l'absence de vaccin, il est recommandé de porter un masque et de se laver fréquemment les mains. La durée d'incubation de l'infection au MERS-nCoV est de 1 à 10 jours et la mortalité est estimée à 60%. Le dépistage se fait par PCR spécifique (polymerase chain reaction).